Quelle étrange époque qu'est l'aube du XXème siècle.
Partout sur le globe, une terrible guerre fait rage, opposant des exorcistes à un certain personnage malveillant: Le Comte Millénaire. Aussi appelé « Le faiseur » ou « Le prince », ce dernier a juré de plonger le monde dans les ténèbres, à l'aide de son armée d'akumas et des membres de sa famille: Les Noahs.
Afin de protéger ceux qui leurs sont chers, de valeureux humains se sont unis pour former une organisation: La congrégation de l'ombre. Existant depuis 100 ans déjà, celle-ci envoie les exorcistes sur le champ de bataille, les seuls êtres capables de lutter contre la menace...Mais avant d'enchainer de multiples combats, leur quête primaire est la recherche d'innocence. Et en particulier d'une ce nommant « Le cœur ».
Les innocences sont en fait des cubes divins contenant de mystérieux pouvoirs aptes à entraver ceux du comte. « Le cœur » est la source de pouvoir de chaque innocence...le détruire reviendrait donc à anéantir toutes les innocences...ce qui serait une défaite inéluctable pour la congrégation. Mais, en revanche, le posséder reviendrait à avoir une force suffisante pour écraser le faiseur une bonne fois pour toute !
Nous savons actuellement que le propriétaire du cœur est actif quelque part mais son identité reste inconnue...

Le noir ou le blanc ?! Les ténèbres ou la lumière ?! Le mal ou le bien ?! Qui triomphera ?!